Jürgen Schaefer war Volontär, dann Redakteur der Allgäuer Zeitung und der Stuttgarter Nachrichten. Als Korrespondent der Agentur „Zeitenspiegel“ berichtete er fünf Jahre lang aus New York City und für drei Jahre aus Havanna, Kuba. Seit 2005 gehört er der GEO-Redaktion an, zunächst als Reporter und Redakteur, dann in der Redaktionsleitung und seit 2023, gemeinsam mit seiner Kollegin Katharina Schmitz, als GEO-Chefredakteur.